Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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