Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms