Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ubxn8Q9QZ49 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms