Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Six6Q9QZ28 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Six6Q9QZ28 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Six6Q9QZ28 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Six6Q9QZ28 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Six6Q9QZ28 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Six6Q9QZ28 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Six6Q9QZ28 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Six6Q9QZ28 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Six6Q9QZ28 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms