Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms