Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall2Q9QX96 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms