Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms