Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms