Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod4Q9JLH8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod4Q9JLH8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod4Q9JLH8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod4Q9JLH8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tmod4Q9JLH8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tmod4Q9JLH8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tmod4Q9JLH8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms