Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl39Q9JKF7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms