Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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