Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim39Q9ESN2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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