Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rtn3Q9ES97 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rtn3Q9ES97 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rtn3Q9ES97 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rtn3Q9ES97 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms