Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cse1lQ9ERK4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cse1lQ9ERK4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms