Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock2Q9ER58 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms