Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms