Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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