Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnpy3Q9DAU1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms