Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim23Q9DAL0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim23Q9DAL0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms