Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem239Q9DA47 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem239Q9DA47 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem239Q9DA47 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem239Q9DA47 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tmem239Q9DA47 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tmem239Q9DA47 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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