Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Subh2bvQ9D9Z7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Subh2bvQ9D9Z7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Subh2bvQ9D9Z7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Subh2bvQ9D9Z7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Subh2bvQ9D9Z7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Subh2bvQ9D9Z7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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