Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms