Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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