Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam3aQ9D8T0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms