Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms