Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms