Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tubgcp4Q9D4F8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tubgcp4Q9D4F8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tubgcp4Q9D4F8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tubgcp4Q9D4F8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Tubgcp4Q9D4F8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tubgcp4Q9D4F8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tubgcp4Q9D4F8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tubgcp4Q9D4F8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tubgcp4Q9D4F8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tubgcp4Q9D4F8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tubgcp4Q9D4F8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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