Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms