Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rasgef1cQ9D300 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1cQ9D300 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms