Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc77Q9CZH8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms