Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hdhd3Q9CYW4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms