Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms