Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ube2fQ9CY34 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ube2fQ9CY34 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ube2fQ9CY34 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ube2fQ9CY34 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ube2fQ9CY34 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ube2fQ9CY34 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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