Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms