Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms