Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms