Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms