Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dis3Q9CSH3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dis3Q9CSH3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms