Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CactinQ9CS00 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CactinQ9CS00 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms