Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms