Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms