Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms