Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5aQ9CQD1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5aQ9CQD1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5aQ9CQD1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5aQ9CQD1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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