Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chchd1Q9CQA6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms