Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prss29Q99MS4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms