Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms