Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms