Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms