Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrbp1Q99J45 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms