Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms